關(guān)于發(fā)布免疫力數(shù)字解碼重大研究計(jì)劃2024年度項(xiàng)目指南的通告

國(guó)科金發(fā)計(jì)〔2024〕125號(hào)

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　　國(guó)家自然科學(xué)基金委員會(huì)現(xiàn)發(fā)布免疫力數(shù)字解碼重大研究計(jì)劃2024年度項(xiàng)目指南，請(qǐng)申請(qǐng)人及依托單位按項(xiàng)目指南所述的要求和注意事項(xiàng)申請(qǐng)。

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國(guó)家自然科學(xué)基金委員會(huì)

2024年4月12日　　

 

免疫力數(shù)字解碼重大研究計(jì)劃2024年度項(xiàng)目指南

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　　免疫力是人體抵御病原入侵，清除抗原性異物，監(jiān)控及維系機(jī)體健康穩(wěn)態(tài)的綜合能力。免疫系統(tǒng)巨大多樣性和復(fù)雜性是免疫力的關(guān)鍵基礎(chǔ)，而傳統(tǒng)研究模式未能系統(tǒng)揭示免疫力生成和演變規(guī)律。本重大研究計(jì)劃鼓勵(lì)科學(xué)問題驅(qū)動(dòng)與數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)相結(jié)合的科研范式變革，資助可產(chǎn)生質(zhì)量高、擴(kuò)展性強(qiáng)、集成性好的免疫力數(shù)據(jù)的項(xiàng)目，建立統(tǒng)一的數(shù)據(jù)匯交管理機(jī)制和平臺(tái)，標(biāo)準(zhǔn)化獲取人體免疫力大數(shù)據(jù)。通過免疫力大數(shù)據(jù)的數(shù)字呈現(xiàn)與深度解碼，全景式認(rèn)知健康及疾病狀況下人體免疫系統(tǒng)的運(yùn)行機(jī)制，多角度闡明免疫力的科學(xué)內(nèi)涵，促進(jìn)精準(zhǔn)診療，服務(wù)于“健康中國(guó)”戰(zhàn)略。

　　一、科學(xué)目標(biāo)

　　基于高質(zhì)量、標(biāo)準(zhǔn)化的免疫力大數(shù)據(jù)，開展人體免疫力整體性和系統(tǒng)性數(shù)字化解析與重構(gòu)研究，揭示免疫力構(gòu)成的生物基礎(chǔ)、免疫力維持的關(guān)鍵特征和免疫力調(diào)控的普適規(guī)律，進(jìn)而闡明免疫力的科學(xué)內(nèi)涵；對(duì)免疫力進(jìn)行定量化表征和數(shù)字化呈現(xiàn)，建立人群免疫力特征圖譜，分析免疫力與衰老、疾病等重大生命健康事件的關(guān)系并闡釋其內(nèi)在機(jī)制和規(guī)律；開發(fā)基于免疫力數(shù)據(jù)的疾病風(fēng)險(xiǎn)預(yù)警、免疫力可視化和免疫力年齡測(cè)定等關(guān)鍵技術(shù)，建立個(gè)體和群體的免疫力檔案，開展基于免疫力干預(yù)的健康維護(hù)及疾病防治新策略，形成未病先防、疾病早診、預(yù)后評(píng)估、個(gè)性化醫(yī)療和健康管理新模式。

　　二、核心科學(xué)問題

　　（一）免疫力復(fù)雜系統(tǒng)的物質(zhì)基礎(chǔ)和動(dòng)態(tài)規(guī)律。

　　針對(duì)免疫力復(fù)雜系統(tǒng)的高度多樣性、時(shí)空動(dòng)態(tài)性、多維交互性、自主適應(yīng)性和模式記憶性等特點(diǎn)，采用動(dòng)態(tài)化、跨尺度、多層次的全景研究新范式，以模型驅(qū)動(dòng)和數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)相結(jié)合的研究方法，明確免疫力復(fù)雜系統(tǒng)的時(shí)空動(dòng)態(tài)特征，闡明免疫力的組成要素、內(nèi)在聯(lián)系與變化規(guī)律等生物學(xué)內(nèi)涵，揭示免疫力本質(zhì)規(guī)律和深層運(yùn)行機(jī)制。

　　（二）多模態(tài)免疫力定量表征及數(shù)字呈現(xiàn)。

　　建立不同免疫力表征狀態(tài)的人群隊(duì)列，獲取并分析免疫分子和細(xì)胞的多樣性信息，系統(tǒng)解析在分子、細(xì)胞、細(xì)胞間關(guān)聯(lián)、器官、人群等不同尺度的免疫力數(shù)據(jù)，形成標(biāo)準(zhǔn)化的多維免疫大數(shù)據(jù)群，對(duì)多源、高維、跨尺度的免疫力數(shù)據(jù)進(jìn)行耦合、重構(gòu)與全景化表征，實(shí)現(xiàn)免疫力數(shù)字化呈現(xiàn)和量化評(píng)估，精準(zhǔn)刻畫免疫力肖像。

　?。ㄈ┗诿庖吡獯a的疾病診療與健康評(píng)估。

　　闡明重大生命健康事件的免疫力特征及其演變規(guī)律，獲取重大疾病在器質(zhì)性病變前的免疫力信號(hào)，設(shè)立基于免疫力解碼的疾病分子分型、精準(zhǔn)診療與預(yù)后評(píng)估標(biāo)準(zhǔn)，并整合傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)證候辨識(shí)和“治未病”等理念與方法，構(gòu)建疾病預(yù)警系統(tǒng)，及時(shí)評(píng)估健康狀態(tài)并發(fā)現(xiàn)疾病早期隱患，為關(guān)鍵生命過程的免疫力干預(yù)提供理論依據(jù)。

　　三、2024年度資助研究方向

　　本重大研究計(jì)劃擬聚焦我國(guó)高發(fā)病/高死亡率惡性腫瘤、自身免疫性疾病等重大疾病，優(yōu)先資助本計(jì)劃尚未立項(xiàng)的疾病類型，針對(duì)不同免疫狀態(tài)，以獲取高質(zhì)量、多維度、時(shí)空動(dòng)態(tài)的人體免疫力大數(shù)據(jù)為前提，鼓勵(lì)依托具有完善基礎(chǔ)數(shù)據(jù)和隨訪方案的隊(duì)列資源，建立關(guān)鍵技術(shù)群，旨在闡明免疫復(fù)雜系統(tǒng)動(dòng)態(tài)協(xié)同模式和時(shí)空交互規(guī)律。本計(jì)劃擬設(shè)置培育項(xiàng)目、重點(diǎn)支持項(xiàng)目及集成項(xiàng)目：

　?。ㄒ唬┡嘤?xiàng)目。

　　圍繞上述科學(xué)問題，以總體科學(xué)目標(biāo)為牽引，立足研究范式創(chuàng)新，對(duì)于探索性強(qiáng)、選題新穎、前期研究基礎(chǔ)較好的申請(qǐng)項(xiàng)目，將以培育項(xiàng)目的方式予以資助，具體研究方向如下：

　　1. 健康狀態(tài)免疫力特征與變化規(guī)律。

　　圍繞不同年齡階段（如嬰幼兒、青春期、成年、老年等），不同健康狀態(tài)（如長(zhǎng)壽、中醫(yī)偏頗體質(zhì)等），不同遺傳背景或特殊生活環(huán)境的人群，鼓勵(lì)采用高通量多組學(xué)技術(shù)，采集生理狀態(tài)下免疫細(xì)胞發(fā)育與新型細(xì)胞亞群、免疫識(shí)別與活化、免疫記憶與耗竭、免疫代謝與表觀遺傳等免疫力數(shù)據(jù)，豐富免疫系統(tǒng)可測(cè)量參數(shù)，延展免疫力大數(shù)據(jù)的覆蓋維度，解碼免疫行為并揭示深層規(guī)律，建立健康個(gè)體的免疫力檔案。從免疫力維度表征機(jī)體的健康狀態(tài)，實(shí)現(xiàn)人體免疫年齡及健康狀態(tài)的數(shù)字判讀。

　　2. 重大疾病狀態(tài)免疫力動(dòng)態(tài)感知機(jī)制。

　　針對(duì)我國(guó)高發(fā)病/高死亡率惡性腫瘤和自身免疫病等重大疾病，從分子、細(xì)胞、組織、器官、證候等不同尺度，分析疾病發(fā)生發(fā)展等關(guān)鍵環(huán)節(jié)的免疫特征信息，如免疫微環(huán)境、免疫調(diào)節(jié)與耐受、移植免疫排斥、免疫細(xì)胞及其亞群、腫瘤新抗原等，揭示免疫力時(shí)空變化與疾病演進(jìn)過程之間的相關(guān)性和因果性，建立微觀免疫力數(shù)值與宏觀疾病表征之間的定量映射關(guān)系，闡明免疫力在重大疾病時(shí)空演變過程中的動(dòng)態(tài)規(guī)律和機(jī)制。

　　3. 人工智能賦能的免疫力量化表征及數(shù)字化呈現(xiàn)。

　　建立從免疫細(xì)胞群和免疫分子等免疫載體數(shù)據(jù)中捕獲用于量化免疫特征信息的新方法，發(fā)展諸如可解釋機(jī)器學(xué)習(xí)等先進(jìn)人工智能技術(shù)，對(duì)多源、高維、跨尺度的免疫力數(shù)據(jù)進(jìn)行耦合重構(gòu)，開發(fā)前沿計(jì)算模型和大數(shù)據(jù)解析算法，提取可以表征免疫力的多維信息，實(shí)現(xiàn)免疫力的數(shù)字化與全景化呈現(xiàn)。

　　4. 免疫復(fù)雜系統(tǒng)的時(shí)空動(dòng)態(tài)特征。

　　針對(duì)代表性疾病或免疫過程，基于復(fù)雜系統(tǒng)的視角，研究免疫力組成元件、關(guān)系集合、系統(tǒng)結(jié)構(gòu)等關(guān)鍵要素，融合還原論、控制論、系統(tǒng)論等方法，定量研究免疫力的層次性、涌現(xiàn)性、動(dòng)態(tài)穩(wěn)定性、自主適應(yīng)性等復(fù)雜系統(tǒng)特點(diǎn)，研究這些特點(diǎn)與免疫分子、細(xì)胞行為或證候表征等的映射關(guān)系，探究免疫復(fù)雜系統(tǒng)運(yùn)行的主要特征、普適規(guī)律及深層機(jī)制，定量探索免疫力的科學(xué)內(nèi)涵和生物基礎(chǔ)。

　　5. 基于免疫力數(shù)字解碼的重大疾病預(yù)警。

　　圍繞腫瘤、自身免疫性疾病等重大疾病的“未病”狀態(tài)，比對(duì)病變前后及健康人群的免疫力大數(shù)據(jù)，通過免疫檢測(cè)新技術(shù)（如新組學(xué)技術(shù)、流式技術(shù)及其他可視化技術(shù)等）和免疫數(shù)據(jù)智能化分析新方法，挖掘疾病演進(jìn)的特異免疫應(yīng)答模式，鑒定可以表征疾病演進(jìn)的免疫力信號(hào)，構(gòu)建免疫力維度的疾病預(yù)警模型并驗(yàn)證其敏感性和特異性，從免疫力視角發(fā)現(xiàn)重大疾病的早期關(guān)鍵特征，實(shí)現(xiàn)重大疾病的早期精準(zhǔn)診斷。

　?。ǘ┲攸c(diǎn)支持項(xiàng)目。

　　圍繞核心科學(xué)問題，以總體科學(xué)目標(biāo)為牽引，立足研究范式創(chuàng)新，對(duì)于前期研究基礎(chǔ)積累較好，特別是與本重大研究計(jì)劃其它申請(qǐng)項(xiàng)目能夠形成學(xué)科交叉、優(yōu)勢(shì)互補(bǔ)且共同對(duì)總體科學(xué)目標(biāo)形成重要貢獻(xiàn)的申請(qǐng)項(xiàng)目，將以重點(diǎn)支持項(xiàng)目的方式予以資助，具體研究方向如下：

　　1. 免疫力大數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)化獲取與深度挖掘。

　　建立不同免疫狀態(tài)如健康群體、自身免疫病（如系統(tǒng)性紅斑狼瘡、類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎）、惡性腫瘤（如肺癌、肝癌、結(jié)腸癌、胰腺癌）的中國(guó)人群大樣本隊(duì)列，獲取并匯交疾病不同階段（如發(fā)生、發(fā)展、治療前后等）的標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)，完善免疫力多維大數(shù)據(jù)收集的標(biāo)準(zhǔn)與規(guī)范，研發(fā)多尺度免疫力數(shù)據(jù)融合與分析的新方法，發(fā)現(xiàn)疾病發(fā)生發(fā)展等過程中的免疫力特征。

　　2. 免疫組庫等多樣性特征的數(shù)字化呈現(xiàn)。

　　建立TCR、BCR和MHC等免疫多樣性大數(shù)據(jù)捕獲新方法（如重輕鏈全長(zhǎng)獲取和功能性配對(duì)等），發(fā)展免疫組庫大數(shù)據(jù)的編碼規(guī)律深度挖掘、疾病關(guān)鍵特征提取、高維特征信息數(shù)據(jù)降維和多樣性分子功能聚類等關(guān)鍵核心技術(shù)，基于多樣性免疫特征量化表征人體免疫力水平，揭示免疫力多樣性特征與疾病和健康的內(nèi)在關(guān)聯(lián)，刻畫群體和個(gè)體免疫力數(shù)字肖像和時(shí)空?qǐng)D譜，從免疫組庫視角揭示人體免疫力多樣性的動(dòng)態(tài)變化規(guī)律。

　　3. 跨尺度免疫力大數(shù)據(jù)耦合與群體免疫力特征解析。

　　系統(tǒng)整合多中心多來源的數(shù)據(jù)，開展多尺度免疫力大數(shù)據(jù)耦合、分析等新方法輔助臨床樣本隊(duì)列分析的研究，為多中心多來源的數(shù)據(jù)提供生信分析與驗(yàn)證等支撐?；隈詈系亩嘀行臄?shù)據(jù)，研究不同年齡、性別、體質(zhì)和遺傳背景的人群免疫力多樣性和差異性，創(chuàng)建人群免疫力特征圖譜，開展基于免疫力干預(yù)的健康維護(hù)及疾病防治新策略及新措施研究，實(shí)現(xiàn)群體層面免疫力的健康監(jiān)測(cè)與干預(yù)。

　?。ㄈ┘身?xiàng)目。

　　建立一種高致死性惡性腫瘤前瞻性多中心隊(duì)列及健康對(duì)照隊(duì)列，嚴(yán)格按照數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)（詳見附件1）采集并匯交腫瘤及外周血匹配的免疫力大數(shù)據(jù)，揭示敏感性高的腫瘤早期免疫力特征，建立準(zhǔn)確度高、泛化能力強(qiáng)的腫瘤早期診斷人工智能模型并驗(yàn)證其效能，探索模型可解釋性，挖掘腫瘤發(fā)生、進(jìn)展、治療響應(yīng)與免疫力重塑的內(nèi)在科學(xué)規(guī)律與生物學(xué)基礎(chǔ)。

　　具體要求如下：

　　1. 臨床中心數(shù)目不少于5個(gè)；

　　2. 疾病隊(duì)列人數(shù)不少于1000例；

　　3. 健康對(duì)照隊(duì)列人數(shù)不少于300例；

　　4. 腫瘤及外周血匹配例數(shù)不少于300例；

　　5. 鼓勵(lì)采集包括新輔助治療等治療前后對(duì)照樣本。

　　四、2024年度資助計(jì)劃

　　2024年度擬資助培育項(xiàng)目10- 15項(xiàng)，資助直接費(fèi)用資助強(qiáng)度約為80萬元/項(xiàng)，資助期限為3年，培育項(xiàng)目申請(qǐng)書中研究期限應(yīng)填寫“2025年1月1日- 2027年12月31日”；擬資助重點(diǎn)支持項(xiàng)目4- 5項(xiàng)，資助直接費(fèi)用資助強(qiáng)度約為300萬元/項(xiàng)，資助期限為4年，重點(diǎn)支持項(xiàng)目申請(qǐng)書中研究期限應(yīng)填寫“2025年1月1日- 2028年12月31日”；擬資助集成項(xiàng)目1項(xiàng)，資助直接費(fèi)用資助強(qiáng)度約1300萬元/項(xiàng)，資助期限為3年，集成項(xiàng)目申請(qǐng)書中研究期限應(yīng)填寫“2025年1月1日- 2027年12月31日”。

　　五、申請(qǐng)要求及注意事項(xiàng)

　?。ㄒ唬┥暾?qǐng)條件。

　　本重大研究計(jì)劃項(xiàng)目申請(qǐng)人應(yīng)當(dāng)具備以下條件：

　　1. 具有承擔(dān)基礎(chǔ)研究課題的經(jīng)歷；

　　2. 具有高級(jí)專業(yè)技術(shù)職務(wù)（職稱）。

　　在站博士后研究人員、正在攻讀研究生學(xué)位以及無工作單位或者所在單位不是依托單位的人員不得作為申請(qǐng)人進(jìn)行申請(qǐng)。

　?。ǘ┫揄?xiàng)申請(qǐng)規(guī)定。

　　執(zhí)行《2024年度國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目指南》“申請(qǐng)規(guī)定”中限項(xiàng)申請(qǐng)規(guī)定的相關(guān)要求。

　　（三）申請(qǐng)程序。

　　1. 申請(qǐng)人應(yīng)根據(jù)本重大研究計(jì)劃擬解決的核心科學(xué)問題和項(xiàng)目指南公布的擬資助研究方向，自行擬定項(xiàng)目名稱、科學(xué)目標(biāo)、研究?jī)?nèi)容、技術(shù)路線和直接費(fèi)用等。

　　2. 本重大研究計(jì)劃項(xiàng)目實(shí)行無紙化申請(qǐng)，申請(qǐng)人應(yīng)當(dāng)按照科學(xué)基金網(wǎng)絡(luò)信息系統(tǒng)中重大研究計(jì)劃項(xiàng)目的填報(bào)說明與撰寫提綱要求在線填寫和提交電子申請(qǐng)書及附件材料。申請(qǐng)書提交日期為2024年5月16日- 5月23日16時(shí)。

　　3. 申請(qǐng)書中的資助類別選擇“重大研究計(jì)劃”，亞類說明選擇“培育項(xiàng)目”、“重點(diǎn)支持項(xiàng)目”或“集成項(xiàng)目”，附注說明選擇“免疫力數(shù)字解碼”，受理代碼選擇T03，根據(jù)申請(qǐng)的具體研究?jī)?nèi)容選擇不超過5個(gè)申請(qǐng)代碼。

　　培育項(xiàng)目和重點(diǎn)支持項(xiàng)目的合作研究單位不得超過2個(gè)。集成項(xiàng)目的合作研究單位不得超過4個(gè)。

　　4. 申請(qǐng)人在“立項(xiàng)依據(jù)與研究?jī)?nèi)容”部分，首先明確申請(qǐng)對(duì)應(yīng)本項(xiàng)目指南中的資助研究方向，以及對(duì)解決本重大研究計(jì)劃核心科學(xué)問題、實(shí)現(xiàn)本重大研究計(jì)劃科學(xué)目標(biāo)的貢獻(xiàn)。

　　如果申請(qǐng)人已經(jīng)承擔(dān)與本重大研究計(jì)劃相關(guān)的其他科技計(jì)劃項(xiàng)目，應(yīng)當(dāng)在申請(qǐng)書正文的“研究基礎(chǔ)與工作條件”部分論述申請(qǐng)項(xiàng)目與其他相關(guān)項(xiàng)目的區(qū)別與聯(lián)系。

　?。ㄋ模┥暾?qǐng)注意事項(xiàng)。

　　申請(qǐng)人和依托單位應(yīng)當(dāng)認(rèn)真閱讀并執(zhí)行本項(xiàng)目指南、《2024年度國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目指南》和《關(guān)于2024年度國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目申請(qǐng)與結(jié)題等有關(guān)事項(xiàng)的通告》中相關(guān)要求。

　　1. 依托單位應(yīng)當(dāng)按照要求完成依托單位承諾、組織申請(qǐng)以及審核申請(qǐng)材料等工作。在2024年5月23日16時(shí)前通過信息系統(tǒng)逐項(xiàng)確認(rèn)提交本單位電子申請(qǐng)書及附件材料，并于5月24日16時(shí)前在線提交本單位項(xiàng)目申請(qǐng)清單。

　　2. 為實(shí)現(xiàn)重大研究計(jì)劃總體科學(xué)目標(biāo)和多學(xué)科集成，獲得資助的項(xiàng)目負(fù)責(zé)人應(yīng)當(dāng)承諾遵守相關(guān)數(shù)據(jù)和資料管理與共享的規(guī)定（詳見附件數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)和數(shù)據(jù)安全管理要求），項(xiàng)目執(zhí)行過程中應(yīng)關(guān)注與本重大研究計(jì)劃其他項(xiàng)目之間的相互支撐關(guān)系。

　　3. 為強(qiáng)化頂層設(shè)計(jì)，突出本重大研究計(jì)劃創(chuàng)新研究范式和管理模式，申請(qǐng)人須按照指南要求將數(shù)據(jù)采集和匯交（每半年）的目標(biāo)、計(jì)劃和承諾作為附件上傳，并附本人簽字和依托單位蓋章，否則項(xiàng)目申請(qǐng)將不予受理。參考模板可見本重大研究計(jì)劃數(shù)據(jù)平臺(tái)https://ngdc.cncb.ac.cn/idp/。

　　4. 為加強(qiáng)項(xiàng)目的學(xué)術(shù)交流，促進(jìn)項(xiàng)目群的形成和多學(xué)科交叉與集成，本重大研究計(jì)劃將每年舉辦一次資助項(xiàng)目的年度學(xué)術(shù)交流會(huì)，并將不定期地組織相關(guān)領(lǐng)域的學(xué)術(shù)研討會(huì)。獲資助項(xiàng)目負(fù)責(zé)人須參加本重大研究計(jì)劃指導(dǎo)專家組和管理工作組所組織的上述學(xué)術(shù)交流活動(dòng)。

　?。ㄎ澹┳稍兎绞?。

　　國(guó)家自然科學(xué)基金委員會(huì)交叉科學(xué)部三處

　　聯(lián)系電話：010-62327096

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附件1

數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)?

　　所有項(xiàng)目產(chǎn)生的數(shù)據(jù)須有完備的患者臨床信息及匹配的高通量組學(xué)數(shù)據(jù)(數(shù)據(jù)類型見下文)。患者臨床信息包括個(gè)體健康體檢信息和疾病診斷、治療、預(yù)后等隨訪信息。項(xiàng)目負(fù)責(zé)人必須依照指南要求標(biāo)準(zhǔn)提供數(shù)據(jù)。項(xiàng)目申請(qǐng)書須描述樣本數(shù)量及年度數(shù)據(jù)產(chǎn)生計(jì)劃，數(shù)據(jù)的樣本數(shù)量與數(shù)據(jù)規(guī)范將被納入評(píng)審和考核標(biāo)準(zhǔn)。

　　一、樣本收集要求

　　腫瘤樣本須有腫瘤組織和血液樣本。樣本須有準(zhǔn)確的臨床病理信息，包括診斷、治療、預(yù)后等隨訪信息，須配備病理切片H&E染色結(jié)果。若有剩余樣本，可冷凍保存以供后期實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。其他疾病如自身免疫病等疾病樣本根據(jù)疾病特點(diǎn)和檢測(cè)手段取樣，具體要求可參考腫瘤樣本。要求如下：

　　1. 樣本采集標(biāo)準(zhǔn)

　　1.1 組織標(biāo)本：組織標(biāo)本應(yīng)盡量去除壞死組織、血漬污物等可能影響檢測(cè)結(jié)果的成分，根據(jù)不同的研究目的進(jìn)行OCT包埋、福爾馬林固定、液氮速凍、組織解離等初步處理，以上步驟應(yīng)在標(biāo)本離體60分鐘內(nèi)完成。腫瘤標(biāo)本應(yīng)包括無壞死的腫瘤組織，其他類型組織標(biāo)本如淋巴結(jié)須選取有代表性的病變組織區(qū)域，組織標(biāo)本的質(zhì)量須至少滿足基礎(chǔ)型數(shù)據(jù)的實(shí)驗(yàn)需求；

　　1.2 外周血樣本：按照不同的實(shí)驗(yàn)要求收集相應(yīng)量的外周靜脈血標(biāo)本，采集量須滿足基礎(chǔ)型數(shù)據(jù)實(shí)驗(yàn)需求。依據(jù)實(shí)驗(yàn)需要對(duì)樣本進(jìn)行分離、凍存等處理，血漿或血清的提取須在30分鐘內(nèi)完成，-80℃保存。其他相應(yīng)操作如免疫細(xì)胞分選等應(yīng)在采樣后12小時(shí)內(nèi)完成。

　　2. 樣本的質(zhì)量控制

　　2.1 腫瘤組織：腫瘤組織質(zhì)量不低于0.5克，腫瘤樣品純度不低于60%，腫瘤組織壞死率小于20%。腫瘤組織須有病理切片以準(zhǔn)確判斷腫瘤組織類型和組織學(xué)特征。其他組織要求參考腫瘤組織的質(zhì)量控制標(biāo)準(zhǔn)；

　　2.2 血液樣本：無凝血和溶血等情況，如進(jìn)行免疫細(xì)胞分選，每例分離出的PBMC數(shù)量應(yīng)大于8×10⁶，T細(xì)胞數(shù)量大于3×10⁶，B細(xì)胞數(shù)量大于1×10⁶，細(xì)胞存活率大于95%。

　　3. 樣本的運(yùn)輸：使用專用保存液、干冰或者液氮進(jìn)行組織樣本及外周血標(biāo)本的運(yùn)輸。

　　4. 樣品的保存：凍存于-80℃冰箱或者液氮中，須分裝保存，避免反復(fù)凍融。

　　5. 樣本必須提供詳細(xì)的臨床病理信息，具體要求如下：

　　5.1樣本采集對(duì)象的可追溯唯一ID（如住院號(hào)等）；

　　5.2 樣本采集對(duì)象的病理類型、病理分期（如TNM分期）、病理切片編號(hào)、診斷時(shí)間、實(shí)驗(yàn)室檢查結(jié)果、影像學(xué)報(bào)告等；

　　5.3 樣本采集時(shí)間、地點(diǎn)、采集方式（活檢/手術(shù)切除等）、樣本運(yùn)輸保存方式（冷凍組織、冰凍切片、石蠟切片等）、樣本量（克、毫升）、樣本純度、組織壞死率；

　　5.4組織樣本及血液樣本所作檢測(cè)名稱、檢測(cè)技術(shù)路徑、檢測(cè)數(shù)據(jù)報(bào)告。

　　二、臨床信息數(shù)據(jù)類型

　　可追溯唯一識(shí)別ID、性別、年齡、民族、地區(qū)、血型、身高、體重、過敏史、惡性腫瘤家族史、免疫疾病家族史、感染史、吸煙史、飲酒史等；實(shí)驗(yàn)室檢查（樣本采集時(shí)）、影像學(xué)檢查、病理檢查報(bào)告、治療情況和預(yù)后情況等，特別是隨訪信息和治療響應(yīng)情況。

　　三、高通量組學(xué)數(shù)據(jù)類型

　　1. 外周血

　　TCR-Seq、BCR-Seq、單細(xì)胞多組學(xué)檢測(cè)技術(shù)（scRNA-seq、scATAC-seq、scTCR-seq、scBCR-seq），鼓勵(lì)獲取TCRαβ鏈配對(duì)數(shù)據(jù)、BCR輕重鏈配對(duì)數(shù)據(jù)、以及對(duì)應(yīng)抗原的匹配數(shù)據(jù)，鼓勵(lì)通過CyTOF等方法獲得淋巴細(xì)胞精細(xì)分群數(shù)據(jù)。

　　2. 組織樣本

　　TCR-Seq、BCR-Seq、WES（包括組織樣本和對(duì)應(yīng)個(gè)體外周血）、RNA-Seq、單細(xì)胞多組學(xué)檢測(cè)技術(shù)（scRNA-seq、scATAC-seq、scTCR-seq、scBCR-seq），鼓勵(lì)獲取TCRαβ鏈配對(duì)數(shù)據(jù)、BCR輕重鏈配對(duì)數(shù)據(jù)、以及對(duì)應(yīng)抗原的匹配數(shù)據(jù)，鼓勵(lì)通過CyTOF等方法獲得淋巴細(xì)胞精細(xì)分群數(shù)據(jù)。

　　四、數(shù)據(jù)質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)

　　1. bulk TCR/BCR測(cè)序數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)：外周血單樣本clonotypes平均值不低于100,000種，組織樣本clonotypes平均值不低于10,000種，重鏈和輕鏈各不少于1,000,000讀數(shù)，單樣本測(cè)序量不低于2Gbp （其中有效clonotype的定義為：能夠組裝出全長(zhǎng)氨基酸序列且不包含終止密碼子，具有明確的胚系V和J基因信息，同時(shí)CDR3區(qū)域含有典型的保守序列）。

　　2. bulk RNA-Seq測(cè)序標(biāo)準(zhǔn)：DV200不低于50%，檢測(cè)覆蓋不低于50M reads。

　　3. WES測(cè)序標(biāo)準(zhǔn)：單堿基覆蓋率不低于100X，檢測(cè)盒覆蓋不低于32MB。

　　4. 單細(xì)胞檢測(cè)技術(shù)指標(biāo)：

　　4.1 scRNA-seq：測(cè)序指標(biāo)（有效barcodes不低于75%，有效UMIs不低于75%，RNA read Q30不低于75%）；細(xì)胞指標(biāo)（單個(gè)樣本細(xì)胞數(shù)不少于5000個(gè)，平均每個(gè)細(xì)胞的測(cè)序read pairs數(shù)大于20000，單個(gè)細(xì)胞基因中位數(shù)大于1000）；

　　4.2 scTCR-seq/scBCR-seq：平均每個(gè)細(xì)胞所測(cè)得的VDJ文庫read pairs數(shù)不低于5000，RNA read Q30 不低于75%，有效barcodes不低于75%；細(xì)胞指標(biāo)（3000-80000個(gè)細(xì)胞/芯片）；

　　4.3 scATAC-seq: 測(cè)序指標(biāo)（測(cè)序read pairs不小于25000，有效barcodes不低于75% ，barcode Q30大于65%，read1/2 Q30大于65%，樣本指數(shù)的Q30大于90%）；細(xì)胞指標(biāo)（單個(gè)樣本細(xì)胞數(shù)不少于5000個(gè)，高質(zhì)量測(cè)序片段大于40%）。

　　五、其他要求

　　1. 申請(qǐng)人須嚴(yán)格遵守《中華人民共和國(guó)生物安全法》《中華人民共和國(guó)人類遺傳資源管理?xiàng)l例》等有關(guān)規(guī)定，并嚴(yán)格遵守醫(yī)學(xué)倫理和患者知情同意等規(guī)范要求。涉及人類遺傳資源研究的項(xiàng)目申請(qǐng)書中應(yīng)提供所在單位或上級(jí)主管單位倫理委員會(huì)的審核證明（電子申請(qǐng)書應(yīng)附掃描件），否則將不予受理。

　　2. 獲資助的項(xiàng)目須按要求進(jìn)行相關(guān)科學(xué)數(shù)據(jù)采集，并將原始數(shù)據(jù)每半年上傳至本計(jì)劃指定的數(shù)據(jù)平臺(tái)（https://ngdc.cncb.ac.cn/idp/）。

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附件2

數(shù)據(jù)安全?

　　為加強(qiáng)和規(guī)范科學(xué)數(shù)據(jù)管理，凡獲資助的項(xiàng)目負(fù)責(zé)人須承諾遵循如下數(shù)據(jù)安全管理要求，明確責(zé)任主體，保障科學(xué)數(shù)據(jù)的統(tǒng)一匯交、開放共享及安全利用。

　　一、責(zé)任主體和職責(zé)

　　1.項(xiàng)目負(fù)責(zé)人是數(shù)據(jù)匯交的責(zé)任主體，任何利用我國(guó)人類遺傳資源開展科學(xué)研究（含國(guó)際合作研究）的項(xiàng)目，須遵守《中華人民共和國(guó)人類遺傳資源管理?xiàng)l例》等國(guó)家法律法規(guī)和相關(guān)要求¹，包括但不限于上述管理?xiàng)l例、醫(yī)學(xué)倫理、患者知情同意等。

　　2.本重大研究計(jì)劃設(shè)立的指導(dǎo)專家組（以下簡(jiǎn)稱專家組），負(fù)責(zé)其資助項(xiàng)目所產(chǎn)生數(shù)據(jù)的統(tǒng)籌管理，總體協(xié)調(diào)各項(xiàng)目的數(shù)據(jù)規(guī)范管理和共享共用，推進(jìn)實(shí)現(xiàn)本重大研究計(jì)劃的總體目標(biāo)。

　　3.本重大研究計(jì)劃指定的免疫力數(shù)據(jù)管理平臺(tái)（以下簡(jiǎn)稱數(shù)據(jù)管理平臺(tái)），作為科學(xué)數(shù)據(jù)管理方負(fù)責(zé)數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)歸檔和安全管理，在專家組指導(dǎo)和協(xié)調(diào)下，定期公布本重大研究計(jì)劃所產(chǎn)生的數(shù)據(jù)，推動(dòng)本重大研究計(jì)劃的數(shù)據(jù)統(tǒng)一匯交管理和安全共享利用。

　　二、數(shù)據(jù)匯交

　　1. 凡產(chǎn)生數(shù)據(jù)的資助項(xiàng)目，項(xiàng)目負(fù)責(zé)人須明確擬產(chǎn)出數(shù)據(jù)的類型、數(shù)據(jù)量、匯交時(shí)間、訪問權(quán)限等，且須按照年度工作計(jì)劃向數(shù)據(jù)管理平臺(tái)匯交數(shù)據(jù)，所有數(shù)據(jù)的匯交不晚于項(xiàng)目結(jié)題時(shí)間，數(shù)據(jù)共享訪問權(quán)限由項(xiàng)目負(fù)責(zé)人設(shè)定。

　　2. 項(xiàng)目負(fù)責(zé)人須提供樣本采集信息、個(gè)體臨床信息及匹配的高通量組學(xué)數(shù)據(jù)等，準(zhǔn)確且詳細(xì)的描述相關(guān)元數(shù)據(jù)，完成基礎(chǔ)型數(shù)據(jù)及其他拓展性數(shù)據(jù)的原始數(shù)據(jù)和元數(shù)據(jù)（包括采樣和臨床）匯交。匯交數(shù)據(jù)的質(zhì)量和體量是年度考核的重要依據(jù)。

　　3. 匯交共享數(shù)據(jù)如涉及人類遺傳資源數(shù)據(jù)，項(xiàng)目負(fù)責(zé)人在提交數(shù)據(jù)前，應(yīng)對(duì)個(gè)人信息采取去標(biāo)識(shí)化處理，以確保隱私保護(hù)和安全利用。在數(shù)據(jù)提交時(shí)，應(yīng)明確說明數(shù)據(jù)目標(biāo)使用者（即僅限國(guó)內(nèi)用戶或國(guó)內(nèi)外用戶均可）及數(shù)據(jù)使用范圍等相關(guān)信息。

　　三、數(shù)據(jù)共享

　　1. 數(shù)據(jù)共享遵循“開放為常態(tài)，不開放為例外”原則，數(shù)據(jù)管理平臺(tái)為本重大研究計(jì)劃各項(xiàng)目提供數(shù)據(jù)統(tǒng)一匯交和安全共享服務(wù)。

　　2. 數(shù)據(jù)在開放共享前，項(xiàng)目負(fù)責(zé)人應(yīng)遵循《人類遺傳資源管理?xiàng)l例實(shí)施細(xì)則》的相關(guān)規(guī)定，完成人類遺傳資源信息的備案?jìng)浞莺褪孪葓?bào)告。

　　3. 本重大研究計(jì)劃的數(shù)據(jù)管理平臺(tái)提供兩種共享方式：公開訪問和受控訪問。公開訪問，即無需訪問權(quán)限或申請(qǐng)程序，用戶可自由獲取和使用已公開發(fā)布的數(shù)據(jù)及對(duì)應(yīng)的元數(shù)據(jù)信息；受控訪問，即采用“申請(qǐng)-審核”制獲取數(shù)據(jù)訪問權(quán)限，數(shù)據(jù)使用者在數(shù)據(jù)管理平臺(tái)向數(shù)據(jù)對(duì)應(yīng)的項(xiàng)目負(fù)責(zé)人提出使用申請(qǐng)，項(xiàng)目負(fù)責(zé)人審核申請(qǐng)并反饋審核意見。

　　4. 為加強(qiáng)本重大研究計(jì)劃各項(xiàng)目之間的數(shù)據(jù)共享利用及其相互支撐，申請(qǐng)使用數(shù)據(jù)的項(xiàng)目負(fù)責(zé)人須在數(shù)據(jù)管理平臺(tái)中提出數(shù)據(jù)使用申請(qǐng)并明確數(shù)據(jù)用途，數(shù)據(jù)匯交的項(xiàng)目負(fù)責(zé)人對(duì)申請(qǐng)進(jìn)行審核。專家組統(tǒng)籌協(xié)調(diào)各方在數(shù)據(jù)共享、整合利用、專利論文發(fā)表等方面的權(quán)責(zé)、義務(wù)等事項(xiàng)。

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¹2018年4月國(guó)務(wù)院辦公廳印發(fā)的《科學(xué)數(shù)據(jù)管理辦法》；2019年7月1日起實(shí)施的《中華人民共和國(guó)人類遺傳資源管理?xiàng)l例》；2023年7月1日起實(shí)施的《人類遺傳資源管理?xiàng)l例實(shí)施細(xì)則》；2021年4月15日施行的《中華人民共和國(guó)生物安全法》；2021年9月1日實(shí)施的《中華人民共和國(guó)數(shù)據(jù)安全法》；2021年11月1日起實(shí)施的《中華人民共和國(guó)個(gè)人信息保護(hù)法》。

 

? ? ?來源:國(guó)家自然科學(xué)基金委員會(huì)

 

單位介紹:

我單位主要從事國(guó)家級(jí)科技成果評(píng)價(jià)、國(guó)家科技計(jì)劃項(xiàng)目申報(bào)咨詢、項(xiàng)目戰(zhàn)略研討、專家考察調(diào)研、研發(fā)平臺(tái)搭建、開展科技政策培訓(xùn)、企業(yè)內(nèi)訓(xùn)等相關(guān)業(yè)務(wù)。利用強(qiáng)大的專家資源，為廣大科研工作者及科技型企事業(yè)單位提供專業(yè)化服務(wù)。

近期相關(guān)科技培訓(xùn):

4月24-27日武漢、5月22-25日深圳|2024年科技項(xiàng)目申報(bào)與科研平臺(tái)建設(shè)運(yùn)行、經(jīng)費(fèi)使用管理、綜合績(jī)效評(píng)價(jià)專題培訓(xùn)班

5月15-18日蘇州 |2024年國(guó)家科技計(jì)劃項(xiàng)目申報(bào)和科研平臺(tái)建設(shè)運(yùn)行、科研經(jīng)費(fèi)全過程管理與信息化建設(shè)高級(jí)研修班

5月22-25日西安、6月12-15日青島|面向新質(zhì)生產(chǎn)力的國(guó)家科技計(jì)劃項(xiàng)目申報(bào)和科研平臺(tái)建設(shè)運(yùn)行、科研經(jīng)費(fèi)全過程管理與信息化建設(shè)高級(jí)研修班

4月23-26日杭州|高價(jià)值專利布局、專利檢索分析及科技成果轉(zhuǎn)化運(yùn)用能力提升培訓(xùn)班

4月23-26日蘇州 |專利檢索、專利信息分析與科技成果轉(zhuǎn)移轉(zhuǎn)化操作實(shí)務(wù)培訓(xùn)班

如有相關(guān)需求可聯(lián)系: 王主任 ，電話:13426056628(同微信)

    

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